何興元，男，滿族，遼寧義縣人。1984年畢業于沈陽農業大學林學系，獲學士學位，同年分配到中國科學院沈陽應用生態研究所(原林土所)工作，1997年于中國科學院沈陽應用生態研究所獲博士學位。1995年于加拿大阿爾伯塔大學進修，1998年—2008年歷任中國科學院沈陽應用生態所副所長、所長。
歷任中國科學院東北地理與農業生態研究所所長、所學位委員會主任、所學術委員會執行主任、黨委委員、研究員、博士生導師，中國科學院大學現代農業學院副院長、崗位教授。
兼任《應用生態學報》副主編，中國生態學會第七屆、第八屆理事會副理事長，第九屆、第十屆理事會常務理事;中國林學會第十屆理事會常務理事，中國林學會森林生態分會副主任委員;中國植物學會第十三屆、十四屆、十五屆理事會理事、常務理事。遼寧省生態學會第四屆常務理事會理事長，遼寧省植物學會第七屆理事會副理事長，遼寧省林學會第八屆常務理事會副理事長。吉林省十二屆人大代表，環資委委員;吉林省科協第九屆委員會常委，長春市科協第八屆委員會副主席。
主要從事區域生態、森林生態、城市森林等方面的研究工作。先后共主持973課題、重點基金、國家重大專項課題、國家攻關課題、中科院重大項目等30余項科研課題。在區域生態變化評估、城市森林結構與功能、城市森林樹種選擇與構建模式、水源涵養林及河岸帶植被恢復、森林資源利用等方面有較深的造詣。
目前主持國家“脆弱區生態恢復專項”重點研發項目“東北森林區生態保護與生物資源開發利用技術與示范”和國家自然科學基金委重點國際合作項目“北方凍土區沼澤濕地退化過程及恢復機制研究”等多項研究。
截至2016年，已在國內外學術刊物上發表論文300余篇。其中：SCI 120余篇(第一或通訊作者80余篇)， CSCD 180篇(第一或通訊作者110余篇)。出版《應用生態學》、《東北地區重要生態功能區生態變化科學評估》、《東北地區重大生態工程生態成效評估》、《沈陽城市森林》、《城市森林生態學研究進展》等專著6部。
共獲各類成果獎十余項，其中，獲國家科技進步二等獎2項(第三、第六);獲吉林省自然科學一等獎1項(第一)，獲遼寧省科技進步一等獎1項(第一)，獲中科院科技促進發展獎一等獎2項，獲梁希林業科技一等獎1項(第五);獲省科技進步一等獎2項(第三、第四);曾獲國務院政府津貼，中國科學院朱李月華優秀教師獎，遼寧省首屆杰出青年科技創業獎(十佳)，遼寧省新世紀百千萬人才工程百人層面，吉林省五一勞動獎章，全國優秀科技工作者等榮譽。
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